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Koh Onimaru
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株式会社ちとせ研究所 / Tech &Biz Development/Senior Bioengineer横浜

Koh Onimaru

株式会社ちとせ研究所 / Tech &Biz Development/Senior Bioengineer

進化生物学・発生生物学の研究から出発し、計算機生物学へ転換した研究者。ゲノム解析、バイオインフォマティクス、深層学習を用いた遺伝子制御ネットワーク予測、がんゲノム解析に従事。Python、R、Javaなどのプログラミング言語を習得。現職を通して、Typescript、AWSを利用したシステム開発、Agent機能を活用した開発なども経験。現在は、データサイエンス x 持続可能社会の可能性を探索している。

株式会社ちとせ研究所3 years

Tech &Biz Development/Senior BioengineerPresent

- Present

AIによる微生物培養の自律制御システムの開発を手掛けている。データサイエンティストの役割に加え、システム開発の責任者として、培養装置とクラウド連携を行うインターフェイスやAI制御を行うWebアプリなどの開発を行っている。

国立研究開発法人理化学研究所5 years

基礎科学特別研究員

-

深層学習によるゲノム配列の機能配列の予測アルゴリズムの開発や、サメ類のゲノム配列の解析や発生生物学的な研究、バイオインフォマティクス的研究を行っていた。

研究員

サメゲノム配列の解析や発生生物学的解析、およびバイオインフォマティクス的な研究を行っていた。

理化学研究所3 years

研究員

-

サメ類のゲノム解析、トランスクリプトーム解析、マウスの四肢発生過程におけるエピジェネティックデータ解析。深層学習を用いたゲノム配列の非コード領域における転写制御配列予測アルゴリズムの開発。

The Centre for Genomic Regulation (CRG, Centre de Regulació Genòmica in Spain) 3 years

Post-doctoral researcher

-

サメ類の骨格パターン形成を反応拡散方程式に基づいた数理モデルにより、モデリングする研究を行っていた。ヒトやマウスとの骨格パターンの違いを数理モデルと実験生物学的アプローチにより理解する取り組みであった。

東京工業大学 生命理工学研究科6 months

博士課程学生

-

進化生物学・発生生物学に関わる研究を実験生物学的手法により実施。魚類のヒレと哺乳類の手足の骨パターン形成過程の違いを研究。

東京工業大学3 years

生命理工学研究科

-

Hidden: Education and Experience

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Skills

  • 応用情報技術者

    0
  • 博士(理学)

    0
  • Python

    0
  • AWS

    0
  • 機械学習

    0
  • Git, TypeScript, Linux and 2 skills

Publications


言語

  • Japanese - Native
  • English - Conversational

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